Bağışıklık sistemi hastalıkları da bebekte kafa ateşi nedenlerindendir. Boğaz enfeksiyonu, idrar yolu enfeksiyonu ve bebekte diş çıkarma gibi durumlar da bebekte baş ateşini yükseltebilir. Bebeğin annesinin memesini emmesi de belli efor harcamasına neden olup, bebekte başta ateş ve terlemeye neden olabilir.